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• 成果转化与社会服务处

按规定设置机构

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• 团委
• 党风廉政建设办公室(党委巡察工作办公室)

教学教辅机构

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• 瑶医药学院
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• 教学教辅党委
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• 校友工作办公室(教育发展基金会秘书处)
• 档案馆

科研机构

• 中医药壮瑶医药研究院
• 海洋药物研究院
• 中药学国家级实验教学示范中心
• 广西壮瑶药重点实验室、壮瑶药协同创新中心
• 广西中药药效研究重点实验室
• 广西壮瑶药工程技术研究中心

附属单位

• 附设中医学校
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